Ubuntu10.10配置R环境的方法(2)

　　整体分为三部分进行管理:

　　1. R本身 和一些库 用 apt-get 进行更新

　　2. 官方推荐包 默认存在于 /usr/lib/R/library 可用管理员权限下的 update.packages() 更新

　　3. 用户安装包 默认存在于 /usr/lib/R/site-library 可用管理员权限下的 update.packages() 更新

　　如果用非管理员的用户去装包, 会装到另外一个新文件夹中. 因为对以上目录没有写权限.

　　如果用非管理员权限装包, 会装到另外一个新文件夹中. 因为对以上目录没有写权限. 用管理员权限会默认装到 /usr/local/lib/R/site-library 里. 更新的时候亦然.

　　sudo gedit /etc/R/Rprofile.site # 修改默认CRAN镜像

　　手工安装依赖了特别库的包

　　安装程序包'Cairo'时退出狀態的值不为0

　　安装程序包'rgl'时退出狀態的值不为0

　　安装程序包'XML'时退出狀態的值不为0:

　　安装程序包'RCurl'时退出狀態的值不为0

　　安装程序包'cairoDevice'时退出狀態的值不为0

　　安装程序包'fftw'时退出狀態的值不为0

　　安装程序包'rcdd'时退出狀態的值不为0

　　安装程序包'rgdal'时退出狀態的值不为0

　　依赖rgl引起的:

　　installation of package 'ks' had non-zero exit status

　　installation of package 'feature' had non-zero exit status

　　installation of package 'flowCore' had non-zero exit status

　　installation of package 'flowViz' had non-zero exit status